Cơ cấu tổ chức của Học viện Cảnh sát nhân dân gồm:
1. Ban Giám đốc Học viện:
Ban Giám đốc Học viện Cảnh sát nhân dân gồm đồng chí Giám đốc và các đồng chí Phó Giám đốc.
2. Các hội đồng: Hội đồng Khoa học và Đào tạo; Hội đồng thi đua khen thưởng, kỷ luật; Hội đồng xét thăng cấp, nâng lương; Hội đồng Văn hóa - Văn nghệ - Thể dục thể thao.
3. Các tổ chức Chính trị - Xã hội: Đảng bộ Học viện; Đoàn Thanh niên Cộng sản Hồ Chí Minh Học viện; Hội Phụ nữ Học viện; Công đoàn Học viện.
4. Các phòng chức năng tham mưu, phục vụ
5. Các khoa giảng dạy về nghiệp vụ và các khoa giảng dạy về kiến thức khoa học cơ bản
6. Tổ chức khoa học và công nghệ, đơn vị sự nghiệp công lập gồm Viện Khoa học Cảnh sát và Trung tâm Lưu trữ và Thư viện; Trung tâm Ngoại ngữ - Tin học; Trung tâm dạy nghề, đào tạo và sát hạch lái xe.
Các tổ chức, đơn vị thuộc Học viện chịu sự lãnh đạo của Đảng ủy, Ban Giám đốc Học viện, hướng tới mục tiêu xây dựng Học viện Cảnh sát nhân dân trở thành trường trọng điểm của quốc gia.